Fidèle à son engagement pour la Science et pour la préservation des océans, Fabrice Amedeo a embarqué un nouveau capteur à bord de son Imoca Nexans – Wewise actuellement en course sur la Transat CIC entre Lorient et New York. Objectif : mesurer et cartographie la biodiversité marine à partir de l’ADN environnemental. L’ADN environnemental c’est tout l’ADN qui est relâché en permanence par les organismes dans leur milieu naturel par le biais d’excrétions (mucus, larves) et de sécrétions (fèces ou urine). Avec ce nouveau capteur développé par les équipes de l’institut Cawthron et leur partenaire technique Sequench, il est possible de filtrer 7 litres d’eau de mer via la pompe DNAutic et d’obtenir rapidement une cartographie biologique précise de tous les organismes présents dans ce milieu, des virus jusqu’aux baleines.
Intégrée à cette initiative révolutionnaire, cette pompe DNAutic présente donc une nouveauté majeure. Cette boîte est une véritable avancée dans son domaine, alliant légèreté, coût abordable et adaptabilité parfaite aux contraintes des bateaux de course. Son fonctionnement peu contraignant est idéal pour les situations de navigation complexes, comme lors du Vendée Globe.
« Cette approche est révolutionnaire car elle permet de recenser la présence ou l’absence d’espèces rares ou en voie de disparition, mais aussi de détecter les espèces invasives et autre pathogènes. Faire l’inventaire du vivant permet de mesurer la santé de nos océans en temps quasi réel et donc d’en appréhender la dynamique due au changement climatique » explique Xavier Pochon, chercheur spécialisé dans la surveillance moléculaire à l’Institut Cawthron et professeur associé en biologie marine à l’université d’Auckland. Passionné par l’ADN environnemental, il est à l’origine de ce projet.
Le projet de capteur d’ADN environnemental installé à bord de l’IMOCA Nexans – Wewise a été permis grâce à l’engagement de l’Institut Cawthron en Nouvelle-Zélande. L’équipe surveille les écosystèmes naturels à l’aide du métabarcodage de l’ADN, qui consiste à examiner un échantillon environnemental à la recherche de microbes et de cellules excrétées par des organismes plus grands, que ces espèces soient déjà connues ou nouvelles. En ce qui concerne la biodiversité marine, Xavier Pochon a constaté un besoin pressant de données supplémentaires « Nous manquons cruellement de données biologiques provenant des quatre coins du monde », explique-t-il. « Nous disposons de modèles étonnants qui prédisent le changement climatique, mais aucun d’entre eux ne contient de données biologiques réelles collectées en mer. Si vous voulez donner un sens au changement climatique et comprendre comment les communautés de plancton évoluent, il est urgent et essentiel de rechercher des données spatio-temporelles solides ».
Les méthodes traditionnelles de recherche océanographique nécessitent une observation visuelle directe, voire la capture physique des espèces concernées, ce qui est lent, coûteux et peut nuire à la vie marine. Xavier Pochon a eu l’idée d’équiper Nexans – Wewise d’un capteur novateur et d’une procédure simple pour prélever des échantillons d’eau de mer à des points clés de son itinéraire. Il s’agit d’un moyen rapide, fiable et inoffensif de suivre les espèces menacées, de surveiller les agents pathogènes et, au fil du temps, de montrer comment le changement climatique modifie l’aire de répartition géographique des espèces.
Dès le retour de New York, l’équipe de surveillance moléculaire de l’Institut Cawthron se mettra au travail, extraira plusieurs millions de séquences d’ADN et identifiera des milliers d’espèces. Grâce aux données déjà disponibles dans les bases de données publiques, l’équipe scientifique pourra utiliser le métabarcodage pour identifier avec certitude des organismes de tout l’arbre de la vie, jusqu’au niveau de l’espèce. Elle examinera les échantillons à l’aide de quatre marqueurs génétiques : un pour les bactéries, un pour tous les eucaryotes (c’est-à-dire toute forme de vie dotée d’un noyau cellulaire), un pour les animaux et un autre ciblant spécifiquement les poissons et les mammifères.
Ce dispositif, qui sera déployé à plus grande échelle sur le Vendée Globe l’hiver prochain, vient compléter le capteur de CO2, de température et de salinité ainsi que le capteur de microplastiques, tous les deux financés par le groupe Onet et installés sur le voilier de Fabrice et utilisés lors des campagnes de mesures océanographiques qui ont lieu dans le cadre de chaque course.
Fabrice Amedeo, ambassadeur Citizens of the Sea : « Je suis vraiment très heureux de prolonger mon engagement citoyen sur l’eau avec l’installation de ce capteur d’ADN environnemental. Après le CO2, la salinité, la température, et le microplastique, ce nouveau projet va nous permettre d’élargir le spectre de nos mesures et d’obtenir une vision globale de l’impact du réchauffement climatique et des pollutions sur les océans et sur la biodiversité. Par ailleurs, travailler avec Xavier Pochon qui est en Nouvelle Zélande et avec ses partenaires scientifiques nous offre l’opportunité de sortir de nos frontières hexagonales et de collaborer, à plus grande échelle, avec des scientifiques présents dans le monde entier ».
A propos Citizens of the sea
Citizens Of The Sea (CoTS; www.citizensofthesea.org) est une nouvelle organisation caritative dédiée à la conservation des océans, co-fondée par l’Institut Cawthron et New Zealand Geographic. CoTS mobilise plaisanciers, régatiers et navires commerciaux pour collecter des données scientifiques précieuses à travers le monde. L’organisation transforme les yachts de croisière et les bateaux de course en navires de recherche mobiles, permettant aux marins de participer à des initiatives de science citoyenne pour mieux comprendre l’impact du changement climatique sur les écosystèmes marins. Les méthodes de collecte de données comprennent l’ADN environnemental, l’analyse de capteurs et la photogrammétrie des récifs coralliens. CoTS travaille main dans la main avec les partenaires et sponsors afin de faciliter la collaboration innovante avec Nexans-WeWise: Cawthron Institute (https://www.cawthron.org.nz), New Zealand Geographic (https://www.nzgeo.com), illumina (www.illumina.com), Qiagen (www.giagen.com), Sequench (www.Sequench.co.nz), Smith-Root (www.smith-root.com), Kiwinet (https://kiwinet.org.nz), et Live Ocean (https://liveocean.com).
